Den diakonala verksamheten, som bland annat innebär att på olika sätt få stöd av kyrkan i Möllevången och Sofielund, är geografiskt främst knuten till S:ta Maria kyrka på Möllevången i Malmö. En betydande del av församlingens diakonala resurser riktas mot socialt arbete som bedrivs i Citydiakonalen.
Förutom arbetet i Citydiakonalen erbjuds även möjlighet till samtal, själavård, hembesök, rådgivning kring fondansökningar, deltagande i leva-vidare-grupper, stöd i samband med myndighetskontakter med mera.