Långhuset, den del av kyrkan där församlingen sitter, är enkelt utformat och bär tydliga drag av medeltida kyrka. De nationalromantiska inslagen i inredning och utsmyckning för tankarna till Dalarna. Kyrkorummet präglas mycket av de blyinfattade fönstren av antikglas, de vackert korgbågade fönsteröppningarna, och det treklöverformade valvet i blågrön ton, som lyfts upp av fyra ankarbjälkar. Väldigt få kyrkor från denna tid har sådana valv, vilket gör Enskede kyrka unik. Kyrkans utsmyckning i form av ornament och bilder kommer fram extra tydligt mot den vitkalkade bakgrunden. Inte minst änglarna i valvet, duvan på väggen bredvig predikstolen och det färgstarka korfönstret.
En intressant detalj är att sakristian ligger under koret, vilket är ett bra exempel på Bergstens skicklighet när det kommer till planlösning. Enskede kyrka skulle användas till annat än strikt religiösa handlingar, därför tillfördes en församlingssal, som är sammankopplad med långhuset genom tre stora dörrar. Församlingssalen fungerar även som en förlängning av långhuset när så behövs.
Passagen genom pentryt och uppför den knarriga trappan leder till den gamla vaktmästarbostaden, som idag gjorts om till kontor. Därifrån kommer man ut till orgelläktaren.