Mark Falsjö studerade vid Kungl. Musikhögskolan i Stockholm med Gotthard Arnér och Rune Engsö som orgellärare. Studierna där avslutades med diplomkonsert 1982 vilken belönades med PA Bergs jeton. Utomlands har han studerat för Flor Peeters i Belgien och David Sanger i England.
År 1984 erhöll han Medborgarskolans musikstipendium och 1996 blev han den första mottagaren av Gotthard Arnérs stipendium för orgelkonstens främjande.
Under 90-talet var Falsjö verksam som producent vid Sveriges Radio P2 i Stockholm. Under dessa år var han också ofta anlitad som organist vid Radiosymfonikernas och Radiokörens konserter.
För snart 30 år flyttade han till Östergötland och har senast varit organist i Vreta klosters kyrka.