I dag är Klara kyrka känd för det stora sociala och diakonala arbete som bedrivs på Sergels torg och de soppluncher som dagligen delas ut till behövande. Sedan 2009 bedriver Föreningen S:ta Clara kyrka verksamheten i kyrkan. Det är en gudstjänstfirande gemenskap inom EFS, Evangeliska Fosterlandsstiftelsen, en väckelserörerelse inom Svenska kyrkan.
Stockholms domkyrkoförsamling ansvarar för den regelbundna musikverksamheten.
Läs mer om S:ta Claras historia här.