Stiftets arbete styrs av kyrkoordningen – det grundläggande dokumentet i Svenska kyrkans interna regelverk. Kyrkoordningen beslutas av kyrkomötet, Svenska kyrkans högsta beslutande organ, som anger ramarna för hur kyrkan är organiserad och hur beslut fattas på nationell, regional och lokal nivå.
Förtroendevalda
Svenska kyrkan är en episkopal kyrka, en "biskopskyrka", där biskoparna ses som efterföljare till Jesu lärjungar och garanter för kyrkans lära. Kyrkan styrs i samverkan mellan biskopar, präster och diakoner och demokratiskt valda beslutsfattare.
Stiftsfullmäktige
Visby stifts högsta beslutande organ är stiftsfullmäktige. I Visby stift är antalet ledamöter 51. De utses genom direktval av de kyrkotillhöriga vart fjärde år. Stiftsfullmäktige fastställer budget, verksamhetsmål och beslutar om stiftets kyrkoavgift.
Stiftsstyrelsen
Stiftsstyrelsen består av elva valda ledamöter. Biskopen är självskriven som ledamot och ordförande. Som ledamot ersätts biskopen av domprosten, medan en vice ordförande utses av stiftsfullmäktige bland de valda ledamöterna.
Domkapitlet
Domkapitlet har anor från medeltiden och fungerade under lång tid som stiftets styrelse. Numera är det ett organ inom den samlade stiftsorganisationen. Domkapitlets ansvarsområden är tydligt avgränsade till det som anges i kyrkoordningen, särskilt stiftets tillsynsuppdrag som är en uppgift domkapitlet delar med biskopen.
Egendomsnämnden
Egendomsnämnden ansvarar för förvaltningen av stiftets prästlönefastigheter samt prästlönefonder. Avkastningen från prästlönetillgångarna ska användas för att bidra ekonomiskt till förutsättningar för kyrkans uppdrag.